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I virus in genere archiviano le loro informazioni genetiche codificate in molecole di DNA o RNA - l'una o l'altra, ma non entrambe. Nell'aprile del 2012, tuttavia, gli scienziati della Portland State University hanno scoperto un virus insolito con un genoma composto sia da RNA che da DNA. Nessuno sa se si tratta di un singolo episodio bizzarro o se ci sono altri virus simili là fuori.
DNA vs. RNA
Praticamente tutti gli organismi viventi trasportano informazioni ereditarie codificate in molecole di DNA. I virus sono un'eccezione insolita. Certo, molti biologi non considerano i virus una forma di "vita" poiché non possono riprodursi da soli. Mentre molti virus hanno genomi del DNA, altri come l'HIV e l'influenza hanno invece genomi ottenuti dall'RNA. L'RNA e il DNA sono molto simili: entrambi sono fatti da catene di unità chimiche fissate insieme da un tipo specifico di legame chimico chiamato legame fosfodiesterico. Vi sono tuttavia due importanti differenze tra RNA e DNA. L'RNA include un'unità chimica non trovata nel DNA chiamata uracile. Inoltre, le unità chimiche in RNA hanno un atomo di ossigeno aggiuntivo attaccato alla parte di zucchero di ciascuna unità. Questa differenza rende l'RNA più instabile e più incline alla rottura.
Genoma ibrido DNA-RNA
Gli scienziati hanno a lungo pensato che i genomi virali potrebbero essere ottenuti da DNA o RNA ma non da entrambi. Nell'aprile del 2012, tuttavia, gli scienziati della Portland State University in Oregon hanno annunciato la scoperta di un virus chiamato virus ibrido RNA-DNA o RDHV nelle acque del Lago di Boiling Springs nel Parco nazionale vulcanico di Lassen. Il genoma di questo virus è fatto di DNA, ma uno dei geni in questo genoma è estremamente simile ai geni trovati solo nei virus dell'RNA, il che suggerisce fortemente che, ad un certo punto in passato, questo virus aveva un genoma ibrido fatto di entrambi DNA e RNA. Il virus è stato trovato nell'acqua del lago facendo scorrere l'acqua attraverso un filtro per catturare i virus per il sequenziamento del DNA, quindi gli scienziati non sanno cosa fa o che tipo di organismo infetta, quanto è abbondante il virus o se può sopravvivere in altri ambienti . Al momento, RDHV è l'unica istanza nota di un virus RNA che forma un ibrido con un virus a DNA.
origini
Esistono due modi in cui un gene di un virus RNA potrebbe essere diventato parte del genoma di un virus a DNA. Un virus RNA e un virus DNA potrebbero aver infettato la stessa cellula contemporaneamente; se uno dei geni dell'RNA fosse convertito o tradotto in DNA, il DNA risultante avrebbe potuto essere confuso con il genoma virale del DNA, creando così l'ibrido. In alternativa, un filamento di DNA e un filamento di RNA avrebbero potuto essere incollati insieme in una cellula infettata da entrambi i tipi di virus. Sulla base di ciò che sappiamo in questo momento, gli scienziati non possono dire con certezza quale di questi due scenari abbia dato origine all'ibrido in Boiling Lake. Né sanno se questo tipo di ibrido avrebbe qualche vantaggio rispetto alla concorrenza.
implicazioni
C'è un numero gigantesco di virus negli oceani del mondo, molti dei quali infettano i batteri. Il millilitro medio di acqua marina contiene circa milioni di virus. La stragrande maggioranza dei virus oceanici non è stata nominata, isolata o identificata, sebbene gli scienziati abbiano raccolto dati sulla sequenza del DNA per migliaia di virus oceanici non ancora identificati attraverso un progetto chiamato Global Ocean Survey. Gli scienziati dello Stato di Portland hanno provato a cercare nei dati del Global Ocean Survey per sequenze simili a quelle nel RDHV per determinare se potrebbero esserci altri virus ibridi RNA-DNA là fuori, e hanno trovato diverse sequenze corrispondenti, tutte da virus non ancora identificati. Questo indizio allettante suggerisce che potrebbero esserci altri virus ibridi RNA-DNA da qualche parte negli oceani del mondo. Sebbene gli scienziati che studiano i virus non stiano cercando specificamente ibridi di RNA-DNA, stanno cercando di saperne di più sulla sconcertante varietà di virus presenti in natura, e mentre questa ricerca progredisce è possibile che possano trovare altri ibridi simili altrove.