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L'Area Under the Disease Progress Curve (AUDPC) è una misura quantitativa dell'intensità della malattia nel tempo. È usato in patologia vegetale per indicare e confrontare i livelli di resistenza alle malattie tra le varietà di piante. Il metodo trapezoidale è il modo più comune per calcolare AUDPC. Viene eseguito utilizzando una formula ideata da Campbell e Madden nel 1990 o tracciando un grafico della percentuale di infezione nel tempo e sommando i trapezi tra intervalli di tempo.
Misura la progressione della malattia
Regole di ricerca e linee guida che si applicano per misurare la malattia specifica e il raccolto che si indaga. La dimensione richiesta del campione vegetale varia a seconda del raccolto e della malattia. Lo studio della peronospora nei tuberi, ad esempio, richiede un campione minimo di 40 piante.
Pianta il numero appropriato di piante richieste per lo studio.
Guarda attentamente per i segni della malattia. Ricerca quando si prevedono segni in modo da essere preparati. Ad esempio, i segni di peronospora si verificano circa 30-40 giorni dopo la semina e 10 giorni dopo l'ultima applicazione di fungicida.
Stimare visivamente la percentuale dell'area fogliare infetta nel campione non appena si nota la malattia.
Registrare la percentuale dell'area fogliare infetta a intervalli di tempo regolari. I ricercatori prendono la lettura della peronospora ogni sette giorni se la malattia progredisce più rapidamente del previsto. Le letture vengono prese ogni 14 giorni quando la progressione della malattia è più lenta.
Interrompere la registrazione delle misurazioni dell'infezione quando la percentuale di infezione smette di aumentare e i livelli di progressione della malattia.
Calcola AUDPC da un'equazione
Aggiungi le prime due percentuali di infezione che hai registrato.
Dividi il risultato dell'addizione per due per trovare il valore medio o medio delle due letture.
Moltiplicare il valore medio o medio per l'intervallo di tempo, che è il numero di giorni dalla prima lettura alla seconda lettura. Se hai preso la prima lettura il giorno 20 e la seconda lettura il giorno 27, ad esempio, il numero di giorni o intervallo di tempo è di sette giorni.
Registra il risultato in unità di giorni percentuali. Il valore è un'area di un trapezio.
Ripeti i passaggi da 1 a 4 per la seconda e la terza lettura di infezione che hai effettuato. Il loro risultato sarà l'area di un secondo trapezio. Ripetere i passaggi da 1 a 4 fino a quando non sono state calcolate le aree trapezoidali per tutte le letture.
Aggiungi tutti i trapezi per trovare AUDPC. AUDPC più bassi rappresentano una progressione più lenta della malattia e una maggiore resistenza alla malattia. AUDPC più elevati rappresentano una più rapida progressione della malattia e una maggiore suscettibilità alla malattia.