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I principali tipi di batteri erano tradizionalmente classificati in base a caratteristiche fisiche o reazioni a diversi tipi di colorazione. L'avvento della genetica molecolare ha permesso una divisione più attenta dei diversi gruppi di batteri. Molti scienziati ritengono che la vecchia classificazione dei batteri dovrebbe essere suddivisa in due o più regni.
Kingdoms
La più alta classificazione degli esseri viventi sono i regni. I batteri un tempo erano classificati in un regno noto come Protista, ma molti scienziati sostengono che il vecchio regno dovrebbe essere diviso in due regni sulla base di prove genetiche molecolari. I nuovi regni sarebbero veri batteri, Eubatteri e batteri antichi, Archaebacteria, che sopravvivono oggi in ambienti estremi. Alcuni suggeriscono una nuova divisione filogenetica nota come domini o superkingdom, perché gli Archaebacteria sono così distinti, che potrebbero essere suddivisi in tre regni: Crenarchaeota, i batteri termofili; Euryarchaeota, batteri alofili e metanogeni; e Korarchaeota, trovato nelle sorgenti calde.
Phylums
Per i batteri diversi dagli archaebacteria, ci sono cinque diversi phylum, il ramo successivo sull'albero filogenetico. I proteobatteri sono simbiotici con le piante e li aiutano a riparare l'azoto dall'atmosfera. I cianobatteri sono noti come batteri blu-verdi. Gli eubatteri sono batteri Gram-positivi classificati tradizionalmente e hanno pareti cellulari che hanno strati diversi rispetto ad altri batteri. Gli Spirochet crescono in colonie a spirale. Le Chlamydiae sono parassiti intracellulari.
Classificazione tradizionale
I batteri possono essere descritti come patogeni (che causano malattie) o non patogeni. Possono anche essere descritti come Gram-positivi o Gram-negativi. Questo si riferisce al fatto che assorbano o meno un colorante dalla colorazione di Gram. I batteri Gram-positivi mancano di una membrana cellulare esterna e i peptidoglicani consentono loro di essere colorati con violetto cristallino. I batteri Gram-negativi hanno una membrana cellulare esterna ma mancano di peptidoglicani, impedendo loro di essere colorati.