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Di dimensioni leggermente inferiori rispetto allo stato americano del Colorado, gli ecosistemi neozelandesi affrontano molte sfide ambientali perché il paese è sia una nazione economicamente sviluppata sia una comunità insulare. Mentre molti paesi sviluppati come gli Stati Uniti affrontano minacce simili per l'ecosistema, come le specie invasive e l'inquinamento industriale, le nazioni insulari come la Nuova Zelanda affrontano minacce crescenti a causa dell'innalzamento del livello del mare globale e della pressione sulle risorse naturali come la pesca oceanica.
Specie invasive
L'introduzione umana di animali e piante non autoctoni negli ecosistemi della Nuova Zelanda ha avuto un grave impatto sulla salute delle specie autoctone. Il kiwi, un uccello incapace di volare che è l'animale nazionale del paese, affronta la minaccia di estinzione con il 90% di tutti i nuovi pulcini che vengono uccisi da specie invasive come stoat, secondo il Dipartimento di Conservazione della Nuova Zelanda. Le piante invasive come gli asparagi rampicanti colpiscono anche gli ecosistemi forestali neozelandesi diffondendosi nell'attuale e impedendo alle piante autoctone di rigenerarsi.
Inquinamento industriale
Una metà stimata di tutti i laghi della Nuova Zelanda è inquinata, la maggior parte dei fiumi non soddisfa gli standard sanitari per il nuoto e la metà di tutti i pesci nativi sono elencati come specie minacciate, secondo l'organizzazione Forest and Bird. La salute di questi corsi d'acqua e dei loro ecosistemi è aggravata dal drenaggio delle zone umide naturali, che fungono da filtri per i corpi d'acqua dolce. L'organizzazione Forest and Bird stima che il 90 percento delle zone umide dei Neozelandesi siano state prosciugate per essere inquadrate e sviluppate.
Cambiamento climatico
Come nazione insulare, gli ecosistemi della Nuova Zelanda sono anche minacciati dall'innalzamento del livello del mare causato dal cambiamento climatico globale indotto dall'uomo. Il Ministero dell'Ambiente della Nuova Zelanda anticipa che i previsti aumenti del livello del mare porteranno ad una maggiore erosione costiera e ad una maggiore intrusione di acqua di mare negli estuari salmastri, tra le altre minacce. Tali cambiamenti minacciano gli ecosistemi di dune e comunità ripariali, che possono essere persi a causa dell'erosione, e gli ecosistemi di estuario, che non sono in grado di tollerare la salinità della pura acqua di mare.
Riduzione della biodiversità
La varietà e la salute di piante e animali aiutano a definire un ecosistema forte e vengono comunemente definiti biodiversità. In Nuova Zelanda, la caccia e la distruzione dell'habitat hanno portato a quello che il Ministero dell'Ambiente considera "un grave declino". I funzionari stimano che il 32% delle terre autoctone e degli uccelli d'acqua dolce in Nuova Zelanda si siano estinti e che altre 800 specie di animali, piante e funghi siano considerate minacciate.