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I metodi di enumerazione nei microbi possono essere suddivisi in quattro categorie. I metodi diretti prevedono il conteggio dei microbi, mentre i metodi indiretti prevedono la stima. I metodi vitali contano solo le cellule metabolicamente attive, mentre i conteggi totali comprendono cellule morte e inattive.
Diretta / Vitale
Un metodo diretto / praticabile prevede un conteggio delle piastre standard, in cui vengono conteggiate diluizioni ripetute di un campione per calcolare il conteggio nel campione originale.
Indiretta / Vitale
Metodi indiretti / vitali come MPN (numero più probabile) comportano un'inferenza statistica sul conteggio dei microbi in base a modelli di crescita.
Diretta / Totale
I microbi vengono contati con l'aiuto di macchie e coloranti fluorescenti, che rendono visibili i microbi con l'aiuto di un microscopio fluorescente.
Indiretta / Totale
La spettroscopia è una forma di enumerazione indiretta / totale, che comporta la stima della quantità di microbi in base alla quantità di luce passata attraverso la coltura da uno spettrofotometro.